本工程施工地段地下水位较高，浅部土层主要为孔隙潜水类型，施工中遇到的地下水主要是顶管工作井施工时及管道顶进过程中从开凿的护壁洞口渗入的地下水。考虑到排水法的优点，本工程采用排水法进行地下水处理。

针对工作井施工时地下水渗入问题，在每层井壁上设置直径50的钢管泄水孔，每开挖一层在井坑中间挖一个直径600的集水井，井深始终要低于井内开挖面1m左右，由工作面流向集水井，再由潜水泵排出地面，以保持正常开挖井内的土体稳定。顶管工作井施工至设计深度后在井内周边设置边沟，井底部设置平面尺寸为800mm×800mm，深1000mm的集水坑，放置潜水泵抽水，保持工作面干燥。针对顶管过程中的地下水入渗，施工方制作了钢结构形式的止水套环。套环外圈焊接在洞口的预埋钢板上，套环内圈是橡胶止水带，安装在工作井壁洞口和管节之间，内圈的橡胶止水带紧贴管节，可以有效止水。水钻取芯时岩层内的裂隙渗水和施工废水可以通过管道汇至顶管工作井的集水坑抽出。